2015年3月,国务院颁布《中国足球改革发展总体方案》,为足球事业改革发展锚定方向。在全面深化改革的大背景下,深圳顺应改革趋势于2019年3月撤销原深圳市足球管理中心事业单位建制,并将其职能整体移交深圳市足球协会。同年8月,经市文化广电旅游体育局机关党委同意将“中共深圳市足球管理中心支部”更名为“中共深圳市足球协会支部”,开启党建引领足球事业发展的新篇章。
2022年6月,党支部圆满完成换届选举产生新一届支部领导班子,设立了党务工作岗位,多年来,党支部始终坚持以党建为核心,推动党建与足球业务深度融合,为深圳足球事业发展提供坚强的组织保障。目前,深圳市足球协会党支部共有7名党员。